许多的科学家都对绿色荧光蛋白展开了研究。据介绍，绿色荧光蛋白由数百个氨基酸组成。氨基酸组成，最初是从多管发光水母中分离出来的，在蓝光照射下会发出绿色荧光。严密的桶形结构保护着荧光基团，防止它被周围环境淬灭，内部面向桶形的环化结构，致使荧光基团形成。近十多年来，绿色荧光蛋白的应用十分普遍。只要是作细胞的基因表达、蛋白定位以及蛋白间的相互作用都要用它，现在甚至应用于观察细胞间的相互作用。它能够使人们直接看到细胞内部的运动情况。在任何指定的时间都可以轻易地找出绿色荧光蛋白在哪儿：你只需要用紫外光去照射，这时所有的绿色荧光蛋白都将发出鲜艳的绿色，这也是人类把它称为绿色荧光蛋白的原因。

绿色荧光蛋白已经被人类应用到各个领域中了。特别突出的应用是在癌症研究的过程中，用荧光蛋白对肿瘤细胞标记使得科学家们能够观测到肿瘤细胞的成长、入侵、转移和新生等具体的过程。此外，像分子生物学，肿瘤生物学，免疫学，内分泌学，肝病学等会应用到它。对于有些研究来说，荧光蛋白的作用可以形容为“起死回生”：一些传统方法需要把生物变成死物才能研究某些现象和过程，而以绿色荧光蛋白为主要支柱之一的现代成像技术，使得科学家可以在活的细胞中观察和研究这些过程，使部分“死物学”变成了“生物学”，有利于科学家们更好的研究生物。

在对绿色荧光蛋白的研究中，用到了一项新的应用技术。有关人士评价说：“生物学中的现代成像技术发展很快，在未来是很有前途的一个领域。成像技术很有远景，因为其既是一种研究工作中必需的手段，又是一项很基础的工作。要达到最后在生物体内看到单分子的运动，现在还完全不能实现，因为非常困难，但这也是科学研究很有发展的一个领域。”目前，我国相当多的生物实验室都在用绿色荧光蛋白，但在研究绿色荧光蛋白如发光机制这方面还比较少。此外，一些科学家也正在发展和开拓新的应用技术，以此来解决生物研究中遇到的困难。